凯发在线平台地球生物基因组计划已对3000个基因组测序|广东公式网|
2024-11-13 19:16:45
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目前来看★ღ✿★★,EBP远没有筹集到必要的数十亿美元★ღ✿★★,并且比原计划落后了好几年★ღ✿★★。但正如组织者在近日结束的一次会议上所明确表示的那样★ღ✿★★,这已经不再是纯粹的愿望★ღ✿★★。到目前为止★ღ✿★★,该项目的全球合作伙伴对1060个线个基因组进行了测序★ღ✿★★,并表示他们有望在2026年达到1万个物种——这是该计划第一阶段的目标★ღ✿★★。
“在过去的两年里★ღ✿★★,通过努力★ღ✿★★,我们完成的基因组数量翻了一倍★ღ✿★★。”该项目的架构师之一凯发在线平台★ღ✿★★、美国亚利桑那州立大学(EBP秘书处所在地)的基因组学家Harris Lewin说★ღ✿★★。项目负责人现在希望到2032年实现167万个物种的目标★ღ✿★★,而且由于目前DNA测序的速度更快★ღ✿★★、成本更低广东公式网★ღ✿★★、准确性更高★ღ✿★★,实现这一目标所需的费用比之前预测的要低数亿美元凯发在线平台★ღ✿★★。
第一阶段工作目前预计花费2.65亿美元★ღ✿★★,不到最初估计的一半★ღ✿★★。未参与这项该计划的美国克莱姆森大学的进化生态学家Antonio Baeza表示★ღ✿★★,这项投资将获得惊人的回报★ღ✿★★。“在某种程度上★ღ✿★★,我们都参与了这个项目★ღ✿★★,因为我们都会从中受益★ღ✿★★。”
Lewin等人在2017年的一次会议上宣布了EBP的基本框架★ღ✿★★,15个国家迅速签署了协议★ღ✿★★。据Lewin说★ღ✿★★,到目前为止★ღ✿★★,来自六大洲28个国家的科学家参与了该计划★ღ✿★★。总的来说★ღ✿★★,EBP有58个“分支机构”★ღ✿★★,其中一些对特定的分类群进行测序★ღ✿★★,一些专注于本地和区域物种★ღ✿★★,还有一些根据保护或农业需求选择物种★ღ✿★★。每个分支机构都有自己的资金和物种清单广东公式网凯发在线平台★ღ✿★★,依靠EBP制定基因组质量标准★ღ✿★★,制定测序方案★ღ✿★★,避免重复工作★ღ✿★★。
Lewin说★ღ✿★★,事实上★ღ✿★★,对于EBP第二阶段计划的15万个基因组广东公式网★ღ✿★★,科学家希望产生非常详细的“参考”基因组★ღ✿★★,而不是最初设想的18万个草图★ღ✿★★。
目前★ღ✿★★,与EBP相关的测序工作每周大约能产生20个详细的真核生物基因组★ღ✿★★。Lewin计算★ღ✿★★,为了赶上2026年第一阶段的最后期限★ღ✿★★,每周需要产生67个这样的基因组★ღ✿★★,为赶上2030年第二阶段的最后期限★ღ✿★★,则需要每周产生721个基因组★ღ✿★★。因此★ღ✿★★,该项目的首要目标是在更多地方发展基因组学专业知识和测序能力★ღ✿★★。
偏远贫困地区的动植物往往是保护和研究需求最大的★ღ✿★★,它们的测序频率却较低★ღ✿★★。Baeza说★ღ✿★★:“EBP的发展几乎没有全球南方国家的参与★ღ✿★★。”
EBP设立了两个委员会★ღ✿★★,以解决伦理凯发在线平台★ღ✿★★、法律★ღ✿★★、多样性和包容性方面的问题★ღ✿★★,并帮助在整个世界——而不仅仅是富裕国家★ღ✿★★,实现数据★ღ✿★★、技术和专长的公平分配★ღ✿★★。
为了帮助弥补一些差距★ღ✿★★,英国维康桑格研究所开发了一个原型便携式DNA测序实验室★ღ✿★★,大小相当于一个9米长的运输集装箱★ღ✿★★,可以将先进的测序技术带到缺乏这种技术的国家凯发在线平台★ღ✿★★。“现在我们正在寻找资方来支持这个想法★ღ✿★★。”维康桑格研究所的进化生物学家 Mark Blaxter说凯发在线平台★ღ✿★★,每个实验室安装和运行3年的成本大约为550万美元★ღ✿★★。他希望各分支机构能至少申请30个这样的实验室★ღ✿★★,并表示如果每个项目每年对1000到3000个基因组进行测序★ღ✿★★,那么第二阶段的目标就可以实现广东公式网★ღ✿★★。
EBP仍然需要数十亿美元资金★ღ✿★★,而要成功地对所有真核生物进行测序★ღ✿★★,它显然面临着更多的挑战广东公式网★ღ✿★★。但是参与其中的研究人员认为★ღ✿★★,即使它只破译了预期基因组的1%★ღ✿★★,“也能对人们关于生物多样性和生态系统的理解作出重大贡献”★ღ✿★★。